吉林大學圖書館醫學館前身即原白求恩醫科大學圖書館，是我國高等學校中專業特色較強的生物醫學專業圖書館。本館始建于1942年，迄今已走過了72個春秋。幾十年來， 醫學館跟隨學校幾經整編、更名和遷址，現館舍建于1985年，建筑面積8400m2，坐落在春城美麗的新民大街上。
　　 吉林大學圖書館醫學館是一所以生物及醫藥衛生專業為藏書主體的高校圖書館，全館現有工作人員33人，其中研究館員2人，副研究館員11人,館員13人,管理員7人。大專以上學歷占92.5%。內設有館長室、綜合辦公室、期刊部、流通部、參考咨詢部等業務部門。為方便讀者，各閱覽室和書庫均實行全方位的開架服務。周開放時間達98小時。 醫學館共有參考閱覽室6個，包括：現刊閱覽室、過刊閱覽室、綜合閱覽室、新書閱覽室、專業閱覽室、參考咨詢閱覽室，共設閱覽室坐位214個；書庫5層，容納中外文圖書、期刊54萬余冊；電子閱覽室2個，擁有164個機座，可向用戶提供網絡、光盤等電子信息的檢索和咨詢服務。
　　醫學館館藏文獻種類齊全，包括中外文圖書、期刊、報紙、本校區博碩論文、音像資料、多媒體光盤、各類數據庫、中外文電子期刊等，形成了一套以生物醫學文獻為主體，兼有人文、社會科學文獻的多種類型、多種載體的館藏體系。其中特藏文獻中，收藏中醫古籍、經史子集、日本版古醫書近7000冊。有許多屬于明、清代的精刻本和抄本。像《注解傷寒論》、《讀素問鈔》、《溪囊便方》、《啟迪集》（日本抄本）等四部書，在吉林省乃至全國也是罕見的珍貴版本，是醫學館的鎮館之寶。而日本版古醫書數量之多，版本質量之高，名列全省榜首。
   醫學館提供的主要服務內容有：館內閱覽、圖書外借、信息咨詢、定題服務、電子文獻及全文檢索、計算機光盤與網絡數據庫檢索、聽音、多媒體光盤閱覽、館際互借、文獻傳遞、文獻復印等。此外，還不定期地舉辦各類計算機醫學文獻檢索等專題講座與培訓。
　　現代圖書館人以研究型、主動性、開放式、電子化為服務宗旨，醫學館還將根據讀者的要求不斷擴大業務范圍，改進服務手段，提高服務質量。